Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制显现出人类肠道的微生态系统目录!

2021-11-22 03:53:36 来源:
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据悉,一项刊登在国际周刊Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究如此一来果报告中都,来自欧洲分子生物学实验室等独立机构的研究小组成员们通过研究如此一来果将生命体肾脏有RX-组成员中都所有已知的菌株序列摘录如此一来了一个大型的资料库系统,从而就能希望研究如此一来果医务人员深入即使菌株基因和蛋白相互间的关联,以及其对生命体健康的影响。

菌株遍布人体内则有,其都能产生蛋白质来影响RX-消化、健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体有RX-组成员如此一来员的数量要比人线粒体还要多,最主要菌株、孢子和其它有RX-;为了理解菌株在生命体生物学中都所充当的关键配角,研究小组成员们通常会在实验室中都分离并对其人才,随后在对菌株开展DNA化学合成,然而现今很多菌株还无法在实验室的环境中都被人才繁殖。

为了拿到这些菌株的相关信息,研究如此一来果医务人员采取了另则有一种方法,他们从环境中都(比如肾脏)抽取单一采样,随后在对整个采样中都的DNA开展化学合成,然后利用计算机方法对来自单一采样中都的数千种物种的变异序列开展重建,这种方法被称之为恒序列学技术,该技术能作为一种替代方法对单个物种的DNA开展分离和化学合成。

研究如此一来果者Rob Finn声称,去年最主要我们在内的三个独立团队重建了如此一来千上万个肾脏有RX-组成员序列,而小得多的问题就是这些团队所得到的结果确实具有可比性,以及确实能将这些结果摘录如此一来为一个更加全面的清单。现今研究如此一来果医务人员已经从生命体肾脏中都超过4600种菌株群落中都摘录了20万个序列和1.7亿个蛋白质序列,这种新型的资料库系统(统合的生命体胃肾脏序列集合和统合的胃肾脏蛋白质书目)洞察了RX-肾脏的相当大多样性,并为进一步开展肾脏有RX-组成员研究如此一来果铺平了道路。

研究如此一来果者绘制造出的这个相当大的书目是有RX-组成员研究如此一来果的一个历史性,将会或将能为研究小组成员们提供更加巨量的人力资源来研究如此一来果生命体肾脏生态系统中都每一种菌株所充当的关键配角。这项研究如此一来果说明,超过70%被侦测到的菌株从而在实验室中都被如此一来功人才过,而其在体内的活性仍然未被发现,而这类菌株中都小得多的群体就是Comantemales;研究如此一来果者声称,看得见Comantemales如此广泛说道一个惊喜,这就凸显了我们的确对肾脏中都的菌株知之甚少,我希望这个书目能希望资料研究家和分子生物学家在将会几年弥补这一知识反之亦然。

该资料库系统/书目抽取的所有资料都能在该软件人力资源Mgnify中都拿到,其能希望研究小组成员们研究有RX-的序列资料并且与这两项的资料库系统开展对比;随着世界各地研究如此一来果团队大大发布新的资料库系统,该书目就会扩大到最主要其它RX-部位的有RX-组成员,比如皮肤或口腔内部等部位。终于研究如此一来果者声称,这一书目的摘录将会或为有RX-学家和化学疗法如此一来果医务人员提供比较丰富的人力资源,然而研究如此一来果医务人员就会在智利、南亚和美洲等代表性过剩的地区发现更多新的菌株物种,现今研究如此一来果医务人员并不吻合相同人群中都菌株多样性的差异和变化情况。

原始造出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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