Science:从基因表达层面类比为何“**有别”

2021-10-13 14:47:56 来源:
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已有的研究者显示,许多繁复的人类所表现型,包括性疾病,都表现成特质取向的特征。这些特质取向被不同程度地归因于内分泌、特质染色体、蛋白质型×同特质恋震荡、行径差异和环境去除的差异。然而,至今为止,它们的系统和大体病理学原理在很大程度上仍然是不得而知的。

蛋白质型-两民间组织表述(GTEx)项目提供了一个机会,让我们可以通过研究者许多以前仍未以这种方式连续特质的两民间组织,来探求人类所RNA两组中所特质取向的普遍特质和遗传学系统。

最近,研究者职员在Science杂志发文。为了连续特质人类所RNA两组及其调控的特质取向,并发掘出同特质恋和生物化学如何交融繁复的特质状和性疾病,研究者职员在GTEx项目(v8数据资料发布新闻)实地调查的44个人类所两民间组织来源中所生成了连续特质及其遗传学调控的特质取向目录,并深入研究者了16245个RNA测序抽取和838个未成年个体的蛋白质型。

在此新的,研究者职员份文件了连续特质水平、两民间组织细胞类型两组合而成和中间体表述定量特质状底物(cis-eQTLs)的特质取向。为了评估它们的因素,研究者职员将这些结果与87个GWAS的蛋白质新功能、RNA系数混合注解和全蛋白质两组相似特质研究者(GWAS)汇总统计相混合。

得出,同特质恋对连续特质的因素是无处不在的 (在所有两民间组织中所,研究者职员鉴定了13 294个有特质取向的蛋白质)。然而,这些因素较大,而且主要是两民间组织特异特质的。

具有特质取向表述的蛋白质主要不是由两民间组织特异特质连续特质驱动的,而是参加了一系列多样化的生物新功能,如药物和降解重排、胚胎发育和两民间组织形态发生、卵子、特质生殖和精子发生、脂肪降解、结核病和免疫重排等。

而X连通蛋白质在女特质中所表述较高,示意了逃避X染色体失活的候选蛋白质,常染色体蛋白质的同特质恋保守特质表述示意了与降解相关的RNA系数调控和额外RNA系数的抑制作用,以及表观生物化学标记的特质取向特质地理分布,之外是两组蛋白H3 Lys27三丝氨酸(H3K27me3)。

连续特质的遗传学调控的特质取向要少得多(在所有两民间组织中所鉴定成了369个同特质恋保守的eQTL),并且具有移动性的两民间组织特异特质。研究者职员发掘出了58个由单一同特质恋的连续特质遗传学调控驱动的蛋白质-特质状相似特质。这些包括特质取向的细胞类型同位素介导蛋白质型-表现型相似特质的底物,以及同特质恋可能在相似特质的潜在小分子系统中所发挥非常直接抑制作用的底物。例如,研究者职员在肝脏中所发掘出了一个女特质特异特质的六激酶HKDC1的eQTL,它因素怀孕女特质的葡萄糖降解,随后反映在氏族的成生身高上。

因此,通过将GTEx数据资料的同特质恋意识深入研究者与蛋白质新功能和RNA系数混合注解相联合,研究者职员描述了导致人类所RNA两组和eQTLs特质取向的两民间组织特异特质和两民间组织共享的驱动各种因素和系统。

研究者职员发掘出了多个特质取向的连续特质震荡,这些震荡与繁复的特质状遗传学相似特质共轭,从而促进了GWAS信号的成因暗示。

由于许多表现型的致病两民间组织是不得而知的,因此对多样化的GTEx两民间组织收集的深入研究者可以作为实地调查同特质恋偏倚特质状基础的强大资源。这项工作对人类所RNA两组的特质取向及其遗传学调控进行了尤其的连续特质。

原始成处:

Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066

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